Bên cạnh khó khăn về thời tiết như vậy, các lái tàu cũng đối mặt với những thách thức khác nhau. Như là việc phải tránh những hòn đảo nổi chềnh ềnh trên mặt nước. Hay là những đá ngầm đang tồn tại trên các tuyến đường thủy. Tất cả đều đang tạo nên thách thức không nhỏ đối với các chủ phương tiện khi lưu thông qua đây.

Bên cạnh sự cẩn thận của các lái tàu thì không thể không nhắc đến sự hướng dẫn của các lực lượng chức năng.

Ngoài công tác xử lý vi phạm trên tuyến, những ca tuần tra của lực lượng CS đường thủy cũng thực hiện công tác tuyên truyền đến các lái tàu. Hay liên tục bố trí lực lượng tại những khu vực nguy hiểm để hướng dẫn tàu thuyền đi qua an toàn.

Quay trở lại điểm đen về tai nạn giao thông, để cảnh báo các lái tàu, phao tiêu đã được lực lượng chức năng tổ chức cắm và phân luồng phương tiện tại đây. Nhưng đó chỉ là giải pháp trước mắt bởi nếu không xử lý những vị trí nguy hiểm thì nguy cơ tiềm ẩn TNGT vẫn luôn hiện hữu tại khá nhiều điểm. Đặc biệt khi vào thời điểm hiện này mực nước hiện đang xuống thấp, dẫn đến thay đổi luồng, lạch đường thủy trên tuyến.